Functionele analyse opzoeken

Wat is een functionele analyse?

In het genetisch rapport staat beschreven in welk gedeelte van het DNA een mutatie is opgetreden en welke verandering dit tot gevolg heeft in het GRIN eiwit en de NMDA receptor. Een functionele analyse is bedoeld om de vertaling te maken van mutatie naar de werking van de NMDA receptor. (Voor meer uitleg, zie: oorzaken)

Een enkele verandering in de NMDA receptor kan meerdere effecten veroorzaken:

De hechting van glucate kan verminderen
De productie van de receptor als geheel kan zo verstoort zijn dat ze niet de rand van de zenuwcel bereiken.
Het magnesium ion in de kern van de receptor kan minder vast komen te zitten waardoor de receptor voortdurend ‘aan’ staat.

Uiteindelelijk wordt het netto effect samengevat in:

Een verminderde werking = Loss Of Function
Een verhoogde werking = Gain Of Function

Voor sommige mutaties is het effect minder makkelijk samen te vatten en wordt het omschreven als ‘complex’.

Let wel: de mutaties hebben betrekking op 1 van de 2 sets van GRIN genen. (zie genetisch rapport). Er zijn dus ook gezonde en goed werkende receptoren.

Hoe wordt een functionele analyse gemaakt?

Voor een functionele analyse worden cellen genetisch gemanipuleerd om de specifieke verandering in het GRIN eiwit te maken. Dit kan met behulp van verschillende middelen:

Genetisch gemodificeerde muizen
Gekweekt menselijk weefsel (via induced pluripotent stem cells)
Genetisch gemodificeerde kikkereieren
Op basis van een theoretisch model

De verschillende methoden hebben ieder hun voor- en nadelen. Genetische manipulatie van kikkers is bijvoorbeeld sneller dan bij muizen. Echter het brein van muizen lijkt weer meer op dat van mensen in vergelijking met kikkers.

Op verschillende plekken in de wereld zijn verschillende expertise centra gespecialiseerd in bepaalde functionele analyse methodes.

Waarom is een functionele analyse belangrijk?

Een functionele analyse biedt de mogelijkheid om een behandeling af te stemmen op de werking van de NMDA receptor.

Bij een Loss Of Function kan in de toekomst medicatie worden voorgeschreven die de werking van de receptor versneld
Bij een Gain Of Function kan in de toekomst medicatie worden voorgeschreven die de werking van de receptor vertraagd

Voor vragen over medicatie raden we aan om contact op te nemen met de behandelend arts of GRIN expertisecentrum ENCORE.

Hoe kan ik een functionele analyse opzoeken of aanvragen?

Het opzoeken van een functionele analyze kan in de GRIN Portal, zie:

https://grin-portal.broadinstitute.org/

Handleiding GRIN portal

Voorbeeld WES rapport voor GRIN2B I751T

Invullen

Hieronder een korte handleiding over het gebruik van de GRIN portal. Als voorbeeld wordt een WES rapport gebruikt voor I751T. (Zie: genetisch rapport)

Ga naar de GRIN portal en selecteer Variant Analysis

Selecteer Variant Analysis

Vul omcircelde velden in en klik op SEARCH

Resultaten

In de onderstaande afbeeldingen zijn de resultaten weergegeven.

De belangrijkste conclusie: No Detectable Effec LoF (Hier kan ook Loss Of Function / Gain Of Function staat)

Scroll naar beneden en selecteer de tap 'Functional Information'

Aanvraag nieuwe functionele analyse bij het Barcelona GRIN team

Wat als er geen functionele analyse beschikbaar is? Neem in dat geval contact op met het Barcelona GRIN team:

Email: bcngrinteam@gmail.com

Aangezien er honderden verschillen mutaties mogelijk zijn en er ook veel mutaties zijn die maar bij één persoon op de wereld voorkomen is er niet voor elke GRIN mutatie een functionele analyse gedaan.

Er zitten geen kosten verbonden aan het aanvragen van een functionele analyse, wel neemt het proces tijd in beslag en kan het op zich laten wachten doordat er een grote vraag naar is.

Aanvraag nieuwe functionele analyse bij CFERV

Het is ook mogelijk om bij het Center for Functional Evaluation of Rare Variants een gratis functionele analyse aan te vragen op basis van genetisch gemodificeerde kikkereieren. Klik op deze link en vervolgens op de knop: request analysis